“生物科學與技術菁英班”是南京農業(yè)大學與中國科學院上海生命科學研究院聯合培養(yǎng)創(chuàng)新人才的新模式。該班學生的招生、本科階段的培養(yǎng)由南京農業(yè)大學負責，按照南京農業(yè)大學管理制度進行管理，并在南京農業(yè)大學完成課程學習。

在本科階段培養(yǎng)期間，中國科學院上海生命科學研究院根據南京農業(yè)大學教學安排，選派優(yōu)秀科研人員開設學術前沿講座和暑期短期講座；選派優(yōu)秀研究生代表與本科生定期開展學術交流討論，培養(yǎng)本科生的學習興趣和科研志向；開辦“暑期學校”；設立創(chuàng)新訓練課題并在南京農業(yè)大學設立“菁英計劃”獎學金，用于鼓勵學業(yè)成績優(yōu)異的“生物科學與技術菁英班”學生。學生的本科畢業(yè)條件及學士學位授予資格按南京農業(yè)大學的相應規(guī)定進行審核，同時可獲得由南京農業(yè)大學和中國科學院上海生命科學研究院聯合頒發(fā)的學習證明。